Préparez vos cartes ! Les duels sont de retour ! Le duel entre Ryôga et Kyôji a ouvert un portail vers l'autre monde. Yûma et ses amis ont été aspirés. De l'autre côté, ils découvrent, effarés, un trou noir dans lequel Kyôji compte précipiter la Terre et le monde astral. Ryôga, Kaito et Yûma vont devoir unir leurs forces pour arrêter Kyôji, mais seront-ils assez forts ?